La metafilaxis es la administración de un medicamento a un grupo de animales previo diagnóstico de una enfermedad clínica en parte del grupo, con el fin de tratar a los animales clínicamente enfermos y controlar la transmisión de la enfermedad a animales en estrecho contacto y en peligro y que ya puedan estar infectados de forma subclínica.
Por animales en “estrecho contacto” se entiende aquellos que comparten las mismas naves, corrales o instalaciones pertenecientes a la misma explotación ganadera en la que se crían los animales clínicamente enfermos sobre los que se ha efectuado el diagnostico, pudiendo prescribirse medicamentos antimicrobianos con fines metafilácticos, solamente durante un tiempo limitado que cubra el periodo de riesgo.